查看原文
其他

Twist 泛癌种cfDNA参照标准品

全面的癌症变异参照标准品,适用于液体活检研究


基于NGS的液体活检是一个快速发展的应用领域,需要准确可靠的参照标准品。Twist泛癌种参照标准品(Twist Pan-cancer Reference Standard)是一种高质量且标准化的对照,适用于基于NGS的液体活检分析的研究和开发。该参照标准品是建立特定癌症变异的分析检测限(LOD)的理想之选,也可作为一种对照追踪NGS检测流程的质量,并在此类分析的研究和开发过程中评估检测过程的保真度。

传统的参照标准品在变异的数量和来源方面存在限制,通常使用来源于细胞系的DNA,这些DNA可能携带非目标的序列变异,且片段长度多变。Twist泛癌种cfDNA参照标准品包含大量多样化的变异供研究使用。该参照标准品通过准确合成变异并精确控制特定的变异等位基因频率(VAF)来生成,很好地模拟了游离DNA和循环肿瘤DNA的大小分布和片段化图谱,能够推动更高性能分析的开发。

该参照标准品包含了模拟循环肿瘤DNA(ctDNA)来合成设计的变异序列,以及来源于人源游离DNA(cfDNA)并高度模拟cfDNA的背景DNA。ctDNA序列通过叠瓦式的设计,含有多条长约167bp的序列,与天然ctDNA非常相似,并覆盖458个不同突变和132个临床上有意义的变异,涉及到与癌症相关的84个基因。

主要优势

全面检测癌症变异

•    458个独特的癌症相关变异

•    132个临床相关的变异    

•    覆盖与癌症相关的84个不同的基因    

背景DNA在设计上更佳

•    背景DNA来源于人类cfDNA样本

•    DNA片段大小图谱和测序后图谱模拟了天然的cfDNA  

专为精确度和灵活性而设计

•    有七种不同的VAF比例可供选择    

•    VAF比例经过微滴式数字PCR验证    

•    提供含有所有VAF比例的方便检测集合    


* 仅供科研使用。不适用于任何诊断或临床程序。


数据 

Twist参照标准品与竞争对手的比较

对Twist cfDNA泛癌种参照标准品和竞争对手参照标准品进行DNA片段分析,表明Twist更好地模拟了天然的游离DNA,提供了更真实的检测结果。

测序后图谱的比较

对Twist和竞争对手的测序后文库大小分布进行比较,显示Twist与天然cfDNA样本有多相似,包括都有锯齿状的前延锋。

阅读原文了解更多

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存